Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms