Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms