Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms