Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPL39P5Q59GN2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPL39P5Q59GN2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPL39P5Q59GN2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPL39P5Q59GN2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RPL39P5Q59GN2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RPL39P5Q59GN2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RPL39P5Q59GN2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL39P5Q59GN2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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