Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms