Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
C5orf47Q569G3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms