Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms