Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms