Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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