Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms