Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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RTN1Q16799 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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RTN1Q16799 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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RTN1Q16799 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RTN1Q16799 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RTN1Q16799 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RTN1Q16799 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RTN1Q16799 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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