Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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