Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms