Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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RPE65Q16518 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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RPE65Q16518 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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RPE65Q16518 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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RPE65Q16518 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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RPE65Q16518 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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RPE65Q16518 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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RPE65Q16518 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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RPE65Q16518 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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