Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GABRA6Q16445 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GABRA6Q16445 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GABRA6Q16445 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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