Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms