Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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E2F4Q16254 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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E2F4Q16254 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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E2F4Q16254 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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E2F4Q16254 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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E2F4Q16254 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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