Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TAF11Q15544 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF11Q15544 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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