Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms