Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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