Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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