Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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