Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMD6Q15008 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms