Protein–RNA interactions for Protein: Q14CW9

ATXN7L3, Ataxin-7-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3Q14CW9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATXN7L3Q14CW9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms