Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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