Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSHL1Q14406 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms