Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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