Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms