Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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GTF2H2Q13888 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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GTF2H2Q13888 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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GTF2H2Q13888 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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GTF2H2Q13888 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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GTF2H2Q13888 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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GTF2H2Q13888 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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GTF2H2Q13888 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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GTF2H2Q13888 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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GTF2H2Q13888 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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GTF2H2Q13888 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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GTF2H2Q13888 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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