Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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