Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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SHROOM2Q13796 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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SHROOM2Q13796 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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SHROOM2Q13796 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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SHROOM2Q13796 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
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SHROOM2Q13796 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
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SHROOM2Q13796 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
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SHROOM2Q13796 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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