Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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