Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms