Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1SQ13698 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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