Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CUL4AQ13619 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4AQ13619 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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