Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD1Q13562 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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