Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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