Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD2Q13200 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms