Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TARDBPQ13148 SPAG5-202ENST00000378976 755 ntTSL 55.33□□□□□ -1.566e-8■■■□□ 16
TARDBPQ13148 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-8■■■□□ 16
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TARDBPQ13148 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.021e-6■■■□□ 15.9
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