Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALCOCO2Q13137 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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CALCOCO2Q13137 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CALCOCO2Q13137 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CALCOCO2Q13137 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CALCOCO2Q13137 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CALCOCO2Q13137 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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