Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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