Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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