Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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