Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
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