Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms