Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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