Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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