Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD3Q12873 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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