Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROQ12816 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TROQ12816 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TROQ12816 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TROQ12816 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TROQ12816 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TROQ12816 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TROQ12816 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TROQ12816 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TROQ12816 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TROQ12816 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TROQ12816 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TROQ12816 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TROQ12816 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TROQ12816 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TROQ12816 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROQ12816 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROQ12816 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROQ12816 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROQ12816 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROQ12816 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROQ12816 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROQ12816 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROQ12816 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROQ12816 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROQ12816 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROQ12816 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROQ12816 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROQ12816 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TROQ12816 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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