Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms